Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPLO60437 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPLO60437 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPLO60437 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPLO60437 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPLO60437 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPLO60437 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPLO60437 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPLO60437 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPLO60437 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPLO60437 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms