Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLIN1O60240 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms