Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCL13O43927 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms