Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms