Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPRY3O43610 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms