Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms