Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR1CO15160 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms