Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KPNA3O00505 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KPNA3O00505 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms