Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLRMTO00411 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLRMTO00411 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms