Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms