Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1D1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms