Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms