Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms