Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF879B4DU55 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms