Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms