Protein–RNA interactions for Protein: A6NLF2

ELOA3D, Elongin-A3 member D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3DA6NLF2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOA3DA6NLF2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms