Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM90A7PA6NKC0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM90A7PA6NKC0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms