Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRCP1A6NGW2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRCP1A6NGW2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms