Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms