Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC78A2IDD5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms