Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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