Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms