Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POMPQ9Y244 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms