Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms