Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms