Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTC7AQ9ULT0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTC7AQ9ULT0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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