Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF608Q9ULD9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms