Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms