Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms