Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms