Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLKQ9UBT6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms