Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD9

CLCF1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, humanhuman

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCF1Q9UBD9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CLCF1Q9UBD9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLCF1Q9UBD9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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