Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms