Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms