Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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