Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms