Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms