Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX2Q9NRD8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX2Q9NRD8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms