Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRDM7Q9NQW5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms