Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms