Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms