Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms