Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPF2Q9HAU5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms