Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNPKQ9C0E8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms