Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms