Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms