Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHANK3Q9BYB0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHANK3Q9BYB0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms