Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms