Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB11FIP5Q9BXF6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms