Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL3Q9BXA9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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